Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD5Q9P267 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms