Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms