Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP6Q9NYH9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms