Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms