Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms