Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms