Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms