Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A20Q9NP91 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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