Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms