Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms