Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms