Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms