Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms