Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOPXQ9BPY8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.9 ms