Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms