Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPTM1LQ96KA5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms