Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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