Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZDHHC12Q96GR4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZDHHC12Q96GR4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZDHHC12Q96GR4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZDHHC12Q96GR4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZDHHC12Q96GR4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms