Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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