Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms