Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GIPC3Q8TF64 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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