Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms