Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms