Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms