Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms