Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC50Q8IVM0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC50Q8IVM0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms