Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC1Q7Z7K0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms