Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms