Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms