Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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