Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HADHQ16836 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HADHQ16836 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms