Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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