Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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