Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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