Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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