Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GRIK4Q16099 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GRIK4Q16099 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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