Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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