Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms