Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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