Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms