Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
R3HDM1Q15032 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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