Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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