Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms