Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOFQ13790 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOFQ13790 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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APOFQ13790 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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