Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms