Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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