Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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