Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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