Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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