Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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